Título provisional de la tesis

Desarrollo de métodos para el ensamblaje de novo de transcriptomas: aplicación al transcriptoma de Allium sativum

Resumen

Las tecnologías de secuenciación masivamente paralela posibilitan la secuenciación de genomas y transcriptomas a un precio asequible. Las herramientas bioinformáticas actuales utilizadas en el ensamblaje de novo de transcriptomas presentan algunos problemas, entre los que destaca la tendencia a sobreestimar el número de genes ensamblado. Con esta Tesis pretendemos poner a punto un método para el ensamblaje de transcriptomas que resuelva este problema. Aplicaremos el método al ensamblaje de novo y la anotación del transcriptoma del ajo (Allium sativum), una planta monocotiledónea de gran importancia económica de la familia Amaryllidaceae. Uno de los principales problemas del ajo cultivado es que sólo se reproduce vegetativamente, lo que dificulta la mejora genética y el desarrollo de nuevas variedades. Esperamos utilizar las secuencias obtenidas para desarrollar marcadores moleculares y otras herramientas útiles para estudiar la biología del género Allium, que comprende numerosas especies de gran importancia económica.

Director: Héctor Candela Antón