Nombre y apellidos: Samuel Daniel Lup

e-mail:

Categoría profesional: Titulado Superior I (IB, UMH)

Título provisional de la tesis

Identificación de interactores genéticos de DEAL1 mediante mutagénesis de segundos sitios.

Resumen

Los escrutinios de mutantes basados en la genética directa han resultado útiles para la identificación de muchos genes, la disección de su función y el descubrimiento de interacciones génicas en los organismos modelo. El abaratamiento de las técnicas de secuenciación masiva ha revitalizado las tediosas estrategias clásicas para la identificación de mutaciones. La cartografía mediante secuenciación (mapping-by- sequencing) combina la secuenciación masiva con las estrategias de análisis de ligamiento y logra la identificación rápida de mutaciones puntuales causantes de un fenotipo de interés. Existen programas que analizan los datos de secuenciación masiva y determinan la posición de la mutación que causa un fenotipo; sin embargo, estos programas son poco amigables, requieren software adicional para completar sus análisis o son relativamente caros. En el laboratorio de J.L. Micol se ha iniciado el desarrollo de Easymap, un programa que automatiza el flujo de trabajo desde los datos brutos de secuenciación masiva hasta las mutaciones candidatas, que puede ser ejecutado por usuarios sin conocimientos informáticos previos.

La simetría bilateral es una propiedad estructural compartida por muchos seres vivos, y uno de los rasgos más visibles de las hojas de muchas plantas. Las hojas vegetativas de los mutantes deal1 de la planta modelo Arabidopsis thaliana manifiestan asimetría bilateral, como consecuencia de la desregulación de la proliferación celular durante el desarrollo foliar. La realización de una mutagénesis de segundos sitios (second site mutagenesis) para encontrar modificadores del fenotipo de un mutante deal1 permitirá una mejor comprensión de la función del gen DEAL1. Esta mutagénesis servirá además como prueba de concepto de la utilidad de Easymap para la identificación de mutaciones mediante secuenciación masiva.

Director: José Luis Micol Molina