Título provisional de la tesis
Estudio de genes implicados en la metilación y desmetilación de residuos de adenosina en el ARNm de Arabidopsis thaliana
Resumen
Mediante esta tesis doctoral pretendemos contribuir al estudio de los genes implicados en la metilación reversible de residuos de adenosina en el ARN mensajero (ARNm) de Arabidopsis thaliana. Esta modificación postranscripcional interna es la más abundante en las moléculas ARNm, y se ha detectado en casi todos los eucariotas estudiados y algunos virus y bacterias. Las proteínas implicadas en la metilación de adenosinas se han clasificado en tres grupos funcionales: (1) proteínas “escritoras”, que introducen grupos metilo en los residuos de adenosina; (2) “borradoras”, desmetilasas encargadas de eliminar los grupos metilo de adenosinas, y (3) “lectoras”, proteínas caracterizadas por poseer un dominio denominado YTH, que media la interacción con el ARN metilado. Para contribuir al conocimiento de esta modificación postranscripcional, estudiaremos genes que codifican proteínas de los tres grupos citados. Esperamos obtener información sobre los efectos de la insuficiencia y la ganancia de función de los genes a estudio, así como su localización subcelular e identificar interacciones entre sus productos proteicos y otras proteínas.
En esta tesis, también hemos estudiado y caracterizado molecularmente a un mutante inducido por metanosulfonato de etilo (EMS). Esta mutación causaba albinismo y letalidad embrionaria en Arabidopsis thaliana. Identificamos la mutación causante mediante la técnica mapping-by-sequencing.
Directo/r: Héctor Candela Antón y Sara Jover Gil
Publicaciones derivadas de la tesis:
Rodríguez-Alcocer E., Ruiz-Pérez E., Parreño R., Martínez-Guardiola C., Berna J.M., Çakmak Pehlivanlı A., Jover-Gil S., Candela H. (2023). Cloning of an Albino Mutation of Arabidopsis thaliana Using Mapping-by-Sequencing. Int J Mol Sci. 24:4196. doi: 10.3390/ijms24044196. PMID: 36835605; PMCID: PMC9964061.
Código ORCID: https://orcid.org/0000-0001-8050-7343